В июле месяце 2012 года комитет по изучению лекарственных препаратов для лечения человека (CHMP) выступил с заявлением, о том, что повышается риск развития злокачественных образований при длительном применении кальцитонина. Основным показанием к длительному применению препарата являлся остеопороз. Для лечении остеопороза кальцитонин применялся в форме назального спрея, поэтому рекомендуется снять с производства эту форму выпуска, и кальцитонин исключить из рекомендаций для лечения остеопороза.
Применение кальцитонина на короткий срок оправдано при таких заболеваниях как паранеопластическая гиперкальциемия, болезнь Педжета и для профилактики острой потери костной ткани.